Sim. Você pode escolher o logotipo e incluir informações da sua empresa no cabeçalho do boleto.
Atenção! O layout do boleto em si não pode ser personalizado. Ele segue um padrão nacional e precisa estar de acordo com as leis vigentes.
Para fazer essa configuração, basta acessar no menu Recebimentos > Boletos > Modelos, clicar no botão verde com +, preencher as informações solicitadas e subir o seu logotipo no campo indicado. Vale lembrar que a imagem deve ter 150x50 pixels e deve estar no formato JPG ou PNG.
Adicione o modelo de boleto no final da página e, pronto, você já tem uma personalização.